La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónicadoi:10.34691/UCHILE/QL5IDXRepositorio de datos de investigación de la Universidad de Chile2022-12-131Cortés-Miranda, Jorge; Rojas-Hernández, Noemi; Muñoz, Gigliola; Copaja, Sylvia; Quezada-Romegialli, Claudio; Veliz, David; Vega-Retter, Caren, 2022, "La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónica", https://doi.org/10.34691/UCHILE/QL5IDX, Repositorio de datos de investigación de la Universidad de Chile, V1, UNF:6:pZ4dfwIgy8yenZowsrtHKw== [fileUNF]La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónicadoi:10.34691/UCHILE/QL5IDXCortés-Miranda, JorgeRojas-Hernández, NoemiMuñoz, GigliolaCopaja, SylviaQuezada-Romegialli, ClaudioVeliz, DavidVega-Retter, CarenRepositorio de datos de investigación de la Universidad de ChileVega-Retter, CarenVeliz, David2022-12-13Earth and Environmental SciencesSilverside fishGene expressionLa contaminación y sus efectos han sido motivo de gran preocupación en las últimas décadas. Se han desarrollado muchas estrategias y marcadores para evaluar sus efectos sobre la biota. Los genes del citocromo P450 (CYP) han recibido mucha atención en este contexto debido a su relación con la desintoxicación y la activación de compuestos exógenos. Si bien su expresión se ha identificado como un biomarcador de exposición a la contaminación, en la mayoría de los casos se ha probado sólo después de exposiciones agudas y para genes CYP asociados con compuestos exógenos. Para dilucidar los patrones de expresión del gen CYP bajo exposición crónica a la contaminación, hemos utilizado como modelo el pejerrey Basilichthys microlepidotus, que habita en la cuenca del río Maipo, un sistema de agua dulce con diferentes niveles de contaminación. Realizamos secuenciación de ARN de próxima generación para tejidos de hígado y branquias de poblaciones contaminadas y no contaminadas. Se observó un patrón de regulación a la baja. La mayoría de los genes CYP asociados con compuestos exógenos mostraron expresión diferencial en las branquias, mientras que los asociados con compuestos endógenos mostraron expresión diferencial en el hígado. Esta respuesta compleja indica que los genes y los tejidos son consideraciones importantes en los estudios que examinan la contaminación utilizando biomarcadores y que su interacción es relevante.Fis_quim_2016_Maipo_river.tab1237text/tab-separated-valuesUNF:6:pZ4dfwIgy8yenZowsrtHKw==SitioUNF:6:34XIDY/FTknaOEFtcCnALg==pH.7.47.91257.80.318465782377721830.012.08.45UNF:6:+mT0Kh9FfTzB+xjVeo/KUg==EC0.8475833333333334.12.00.271.151.00750.316324188806740460.0UNF:6:vVwNUbW/b0glnv/1B1aNDA==DO0.09.7316666666666672.62130374686592410.2512.04.49.12.84UNF:6:usn2sQal5AT42RO1UleGzQ==NO20.53229470950990.0255491881566380.2703107450393110.012.00.16768686099601246.0.26296913908179637UNF:6:wWixErPcALMxCdCVdO7KNg==TS356.9999999999851615.00.01146.9999999999812.0411.9868617352042.1034.0833333333255UNF:6:frxThr+wL+PmTGKdBya89Q==DS1027.49999999996852.083333333321203.9999999999861182.99999999998.12.0369.75654357313610.0UNF:6:dDcVoBTtgiVHVSWkdpJHNg==DBO5.0.03.491.54000000000000050.64000000000000112.00.95953587265359210.970000000000001UNF:6:/KH8mXOJZd0tCG2LpRq3sA==B0.038009169547583780.30.230.00.190.2358333333333333412.0.UNF:6:L1ZAw5S+dS2CehMGPZ9KNA==P2.026558891454970.5073133179368750.658340497029887212.01.25474602899666520.01.34719014626636.UNF:6:j4/qo+PLfiIOyokMpoHZqg==Na.24.07407407407418.4523809523809515.5136684303351040.015.4100529100529014.71072326870114112.0UNF:6:O5GbGJfdV8+OwURSHlZfYA==K.2.5035919540229910.9051724137931032.55747126436781970.012.01.2191053661851084.66954022988506UNF:6:bERNMEeyJIPeiAj3Winaow==Ca102.364864864865.12.00.0122.43243243243232.432432432432433.007328354861188.6373873873874UNF:6:uMnhKOyp+BRV1Bn/WKaUzQ==Mg1.660336575575111.0077968195152051.17834902990067340.00.295827046250290270.970202254129998.12.0UNF:6:1kJyofXgmX+lRsKgAYUtbA==NH40.019.9634187840298.0936649274047158.8848778735632237.7022787428657980.0863770417422868.12.0UNF:6:fQ8NaDNz3A9aqlK+YYUhEQ==NO35.284218703589461.941238832910642.3811734107127891.4775588152537393.0.8564077958279070.012.0UNF:6:+jBRNI7DqDO/ivHI50z0EQ==SS182.000000000004750.0498.00000000001122.8369207156897934.999999999989512.0153.4999999999975.UNF:6:7HlUYudZuJ3mcvKlD+R81g==HCO368.320.0151.8223556321564212.0555.71.217.26166666666668197.03UNF:6:dClUFy3O+XAxOGo7Q7EN5Q==CO312.00.130130.00.466840.56611590872284360.68529.1.84UNF:6:ybihBncH+wz8lWWJgiYXoQ==Cl59.2281795643601336.557741066116191.6163.3504069255746740.010.13.12.0UNF:6:BnLOfQcTAsEqHgD2Jm4AqA==SO40.01.9210.13613959439814.719.5712.0173.52126.19UNF:6:ASvpg7/q4zBApmjWfyJx7A==sed_pH0.07.57.0666666666666660.2146173479954639812.06.87.05.UNF:6:7+eeU6xtSvDkVkxvo/QhIw==sed_EC141.0616.5.12.03140.0887.09803957521050.0880.75UNF:6:TVr0XmFolmwZ13Z0L8n3pg==sed_B0.0.12.00.497255229591836661.18240.47943239795918350.247537659149426270.168048469387755UNF:6:gal/sCqGE8OTENCw0JcPew==sed_N589.037209335846512.00.043.7829327896215.1785.1611727.181445792623614.4738210419827UNF:6:dmEFHPp4/ewxfFJmGI1+tw==sed_P10.7835561234446580.09.207575226244937.54896278929248212.02.7125563834046.29.4227781774294UNF:6:rqlZ0gylnAfD/y3CKN/m8w==sed_Ca0.0088125635521412.459612.00.00.70182556332420250.38264341124966555.0.0984875387105313UNF:6:mqWN9/Ql0kV9nPlPPFh1cQ==sed_Mg0.0.0.063955077324845190.0031429066661228812.00.047726565502800110.027600288547220650.2301UNF:6:LIK9Zm63hTztbogYvRto2g==sed_Na0.4654583233823540.316520778567300150.00.2331971618973070.545365707401569312.0.1.28200383073641UNF:6:tTwgv3JyvE+B+47sa3+bkA==asf_Fe0.012.00.0927.0.22176138001781170.70.173781968933669150.0UNF:6:PCnEcnociBIjGpNMbCAzrQ==asf_Cr0.0063285009474933510.0062416666666666660.01910.00840.0.0.012.0UNF:6:kjNjzLa6irxYxa2uOa7GTg==sed_Cu12.0.4.06905265575122053.694110335381285.21204714579325416.59448130669672.393232964778460.0UNF:6:b4d6Ue7l6E0TgRHQfaUv0w==sed_Fe.132.1570473915810.0111.581726743044161.40975546346478132.9809193757386412.0312.72257183113UNF:6:+F65ugHb4rhdUjD9jd+Eyg==sed_Zn7.3092755647755750.1934839437553097.3499766093008940.017.6109032764885.5.82706899923518712.0UNF:6:zWNO4Hh7Kkuc65qZXmqAAg==sed_Mn0.0286.45309846463112.064.253502618056525.4104661489956.92.5415088366902477.63589417102348UNF:6:Ck5Ig8vGejhHMBYUva48Qg==sed_Ni0.012.00.0.2.279859700941480.6645256638123890.78506144160061460.7506364558662763UNF:6:ALawKD3IK/KvaXOoAQDngA==sed_Cr.1.9374273527654850.012.00.99499096467425971.6334693267901970.02.75794237913738UNF:6:vJ+0syMrz2O4/oTK7AuEnA==Bra_count.rarapplication/x-rar-compressedHig_count.rarapplication/x-rar-compressed