View: |
Part 1: Document Description
|
Citation |
|
---|---|
Title: |
La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónica |
Identification Number: |
doi:10.34691/UCHILE/QL5IDX |
Distributor: |
Repositorio de datos de investigación de la Universidad de Chile |
Date of Distribution: |
2022-12-13 |
Version: |
1 |
Bibliographic Citation: |
Cortés-Miranda, Jorge; Rojas-Hernández, Noemi; Muñoz, Gigliola; Copaja, Sylvia; Quezada-Romegialli, Claudio; Veliz, David; Vega-Retter, Caren, 2022, "La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónica", https://doi.org/10.34691/UCHILE/QL5IDX, Repositorio de datos de investigación de la Universidad de Chile, V1, UNF:6:pZ4dfwIgy8yenZowsrtHKw== [fileUNF] |
Citation |
|
Title: |
La selección de biomarcadores depende de la función genética y del órgano: el caso de los genes de la familia del citocromo P450 en peces de agua dulce expuestos a contaminación crónica |
Identification Number: |
doi:10.34691/UCHILE/QL5IDX |
Authoring Entity: |
Cortés-Miranda, Jorge (Universidad de Chile) |
Rojas-Hernández, Noemi (Universidad de Chile) |
|
Muñoz, Gigliola (Universidad de Chile) |
|
Copaja, Sylvia (Universidad de Chile) |
|
Quezada-Romegialli, Claudio (Universidad de Tarapaca) |
|
Veliz, David (Universidad de Chile) |
|
Vega-Retter, Caren (Universidad de Chile) |
|
Distributor: |
Repositorio de datos de investigación de la Universidad de Chile |
Access Authority: |
Vega-Retter, Caren |
Depositor: |
Veliz, David |
Date of Deposit: |
2022-12-13 |
Holdings Information: |
https://doi.org/10.34691/UCHILE/QL5IDX |
Study Scope |
|
Keywords: |
Earth and Environmental Sciences, Silverside fish, Gene expression |
Abstract: |
La contaminación y sus efectos han sido motivo de gran preocupación en las últimas décadas. Se han desarrollado muchas estrategias y marcadores para evaluar sus efectos sobre la biota. Los genes del citocromo P450 (CYP) han recibido mucha atención en este contexto debido a su relación con la desintoxicación y la activación de compuestos exógenos. Si bien su expresión se ha identificado como un biomarcador de exposición a la contaminación, en la mayoría de los casos se ha probado sólo después de exposiciones agudas y para genes CYP asociados con compuestos exógenos. Para dilucidar los patrones de expresión del gen CYP bajo exposición crónica a la contaminación, hemos utilizado como modelo el pejerrey Basilichthys microlepidotus, que habita en la cuenca del río Maipo, un sistema de agua dulce con diferentes niveles de contaminación. Realizamos secuenciación de ARN de próxima generación para tejidos de hígado y branquias de poblaciones contaminadas y no contaminadas. Se observó un patrón de regulación a la baja. La mayoría de los genes CYP asociados con compuestos exógenos mostraron expresión diferencial en las branquias, mientras que los asociados con compuestos endógenos mostraron expresión diferencial en el hígado. Esta respuesta compleja indica que los genes y los tejidos son consideraciones importantes en los estudios que examinan la contaminación utilizando biomarcadores y que su interacción es relevante. |
Methodology and Processing |
|
Sources Statement |
|
Data Access |
|
Other Study Description Materials |
|
File Description--f410 |
|
File: Fis_quim_2016_Maipo_river.tab |
|
|
|
Notes: |
UNF:6:pZ4dfwIgy8yenZowsrtHKw== |
List of Variables: |
|
Variables |
|
f410 Location: |
Variable Format: character Notes: UNF:6:34XIDY/FTknaOEFtcCnALg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 7.4; Mean 7.9125; StDev 0.31846578237772183; Valid 12.0; Max. 8.45 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:+mT0Kh9FfTzB+xjVeo/KUg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 0.8475833333333334; Valid 12.0; Min. 0.27; Max. 1.15; StDev 0.31632418880674046; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:vVwNUbW/b0glnv/1B1aNDA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 9.731666666666667; StDev 2.621303746865924; Valid 12.0; Min. 4.49; Max. 12.84 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:usn2sQal5AT42RO1UleGzQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 0.5322947095099; Min. 0.025549188156638; Valid 12.0; StDev 0.16768686099601246; Mean 0.26296913908179637 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:wWixErPcALMxCdCVdO7KNg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 356.999999999985; Max. 1615.0; Valid 12.0; StDev 411.9868617352042; Mean 1034.0833333333255 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:frxThr+wL+PmTGKdBya89Q== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 852.083333333321; Min. 203.999999999986; Max. 1182.99999999998; Valid 12.0; StDev 369.7565435731361; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:dDcVoBTtgiVHVSWkdpJHNg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 3.49; Mean 1.5400000000000005; Min. 0.640000000000001; Valid 12.0; StDev 0.9595358726535921; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:/KH8mXOJZd0tCG2LpRq3sA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: StDev 0.03800916954758378; Max. 0.3; Min. 0.19; Mean 0.23583333333333334; Valid 12.0; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:L1ZAw5S+dS2CehMGPZ9KNA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 2.02655889145497; Min. 0.507313317936875; StDev 0.6583404970298872; Valid 12.0; Mean 1.2547460289966652; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:j4/qo+PLfiIOyokMpoHZqg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 24.0740740740741; Min. 8.45238095238095; Mean 15.513668430335104; StDev 4.710723268701141; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:O5GbGJfdV8+OwURSHlZfYA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 2.503591954022991; Min. 0.905172413793103; Valid 12.0; StDev 1.219105366185108; Max. 4.66954022988506 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:bERNMEeyJIPeiAj3Winaow== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; Max. 122.432432432432; Min. 32.4324324324324; StDev 33.0073283548611; Mean 88.6373873873874 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:uMnhKOyp+BRV1Bn/WKaUzQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 1.66033657557511; Mean 1.1783490299006734; StDev 0.29582704625029027; Min. 0.970202254129998; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:1kJyofXgmX+lRsKgAYUtbA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 19.963418784029; Mean 8.884877873563223; StDev 7.702278742865798; Min. 0.0863770417422868; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:fQ8NaDNz3A9aqlK+YYUhEQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 5.28421870358946; Mean 2.381173410712789; StDev 1.4775588152537393; Min. 0.856407795827907; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:+jBRNI7DqDO/ivHI50z0EQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 182.00000000000475; Max. 498.00000000001; StDev 122.83692071568979; Min. 34.9999999999895; Valid 12.0; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:7HlUYudZuJ3mcvKlD+R81g== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 68.32; StDev 151.82235563215642; Valid 12.0; Max. 555.71; Mean 217.26166666666668; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:dClUFy3O+XAxOGo7Q7EN5Q== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; Min. 0.13013; StDev 0.5661159087228436; Mean 0.68529; Max. 1.84 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:ybihBncH+wz8lWWJgiYXoQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 59.22817956436013; Max. 191.61; StDev 63.350406925574674; Min. 10.13; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:BnLOfQcTAsEqHgD2Jm4AqA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 1.9; StDev 210.13613959439814; Max. 719.57; Valid 12.0; Mean 173.52; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:ASvpg7/q4zBApmjWfyJx7A== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 7.5; Mean 7.066666666666666; StDev 0.21461734799546398; Valid 12.0; Min. 6.8; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:7+eeU6xtSvDkVkxvo/QhIw== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 141.0; Valid 12.0; Max. 3140.0; StDev 887.0980395752105; Mean 880.75 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:TVr0XmFolmwZ13Z0L8n3pg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; Mean 0.49725522959183666; Max. 1.1824; StDev 0.24753765914942627; Min. 0.168048469387755 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:gal/sCqGE8OTENCw0JcPew== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; Min. 43.7829327896215; Max. 1785.1611; Mean 727.181445792623; StDev 614.4738210419827 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:dmEFHPp4/ewxfFJmGI1+tw== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Mean 10.783556123444658; StDev 7.548962789292482; Valid 12.0; Min. 2.7125563834046; Max. 29.4227781774294 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:rqlZ0gylnAfD/y3CKN/m8w== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 0.008812563552141; Max. 2.4596; Valid 12.0; StDev 0.7018255633242025; Mean 0.38264341124966555; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:mqWN9/Ql0kV9nPlPPFh1cQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: StDev 0.06395507732484519; Min. 0.00314290666612288; Valid 12.0; Mean 0.04772656550280011; Max. 0.2301 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:LIK9Zm63hTztbogYvRto2g== |
f410 Location: |
Summary Statistics: StDev 0.31652077856730015; Min. 0.233197161897307; Mean 0.5453657074015693; Valid 12.0; Max. 1.28200383073641 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:tTwgv3JyvE+B+47sa3+bkA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 0.0; Valid 12.0; StDev 0.2217613800178117; Max. 0.7; Mean 0.17378196893366915; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:PCnEcnociBIjGpNMbCAzrQ== |
f410 Location: |
Summary Statistics: StDev 0.006328500947493351; Mean 0.006241666666666666; Max. 0.0191; Min. 0.0; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:kjNjzLa6irxYxa2uOa7GTg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; StDev 4.0690526557512205; Mean 5.212047145793254; Max. 16.5944813066967; Min. 2.39323296477846; Variable Format: numeric Notes: UNF:6:b4d6Ue7l6E0TgRHQfaUv0w== |
f410 Location: |
Summary Statistics: StDev 111.58172674304416; Min. 1.40975546346478; Mean 132.98091937573864; Valid 12.0; Max. 312.72257183113 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:+F65ugHb4rhdUjD9jd+Eyg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 0.193483943755309; Mean 7.349976609300894; Max. 17.6109032764885; StDev 5.827068999235187; Valid 12.0 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:zWNO4Hh7Kkuc65qZXmqAAg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Max. 286.453098464631; Valid 12.0; Min. 25.4104661489956; Mean 92.54150883669024; StDev 77.63589417102348 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:Ck5Ig8vGejhHMBYUva48Qg== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Valid 12.0; Min. 0.0; Max. 2.27985970094148; StDev 0.7850614416006146; Mean 0.7506364558662763 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:ALawKD3IK/KvaXOoAQDngA== |
f410 Location: |
Summary Statistics: Min. 0.0; Valid 12.0; StDev 0.9949909646742597; Mean 1.633469326790197; Max. 2.75794237913738 Variable Format: numeric Notes: UNF:6:vJ+0syMrz2O4/oTK7AuEnA== |
Label: |
Bra_count.rar |
Notes: |
application/x-rar-compressed |
Label: |
Hig_count.rar |
Notes: |
application/x-rar-compressed |